W Horrigue, L Ranjard, S Dequiedt.
Predictive model of soil molecular microbial biomass by using the French soil quality monitoring network data.
2nd Thunen Symposium on soil Metagenomics, December 11-13 2013, Braunschweig, Germany.
Communication
Conferences & Communication
2013
S Terrat, S Dequiedt, M lelievre, R Christen, PA Maron, L Ranjard.
Gns-Pipe an optimized bioinformatic pipeline to efficiently assess microbila taxonomic diversity of complex environement using high throughput sequencing technologies.
2nd Thunen Symposium on soil Metagenomics, December 11-13 2013, Braunschweig, Germany.
Sébastien TERRAT, Samuel DEQUIEDT, Nicolas CHEMIDLIN, Florentin Constancias, Vincent TARDY, Walid Horrigue, Pierre Alain MARON, Lionel RANJARD.
Distribution spatiale et traduction fonctionnelle de la diversité microbienne des sols. Congres génomique environnementale.
Rennes novembre 2013.
HORRIGUE Walid, DEQUIEDT Samuel, PAMARON Pierre Alain, Ranjard Lionel.
Modèles prédictifs de l'abondance et de la diversité microbienne tellurique.
Congres AFEM, 22-25 octobre 2013, Parent (Puy-de-Dôme).
Sébastien TERRAT, Pierre PLASSART, Emilie BOURGEOIS, Stéphanie FERREIRA, Mélanie LELIEVRE, Tiffanie REGNIER, Virginie NOWAK, Samuel DEQUIEDT, Philippe LEMANCEAU, Antonio BISPO, Abbad CHABBI, Pierre-Alain MARON, Lionel RANJARD.
Optimisation de la procédure d’extraction d’ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par pyroséquençage des gènes ribosomiques.
Congres AFEM, 22-25 octobre 2013, Parent (Puy-de-Dôme).
Tardy V, Mathieu O, Leveque J, Chabbi A, Lemanceau P, Ranjard L, Maron PA.
La perte de diversité affecte la stabilité structurelle et fonctionnelle des communautés microbiennes du sol.
Congres AFEM, 22-25 octobre 2013, Parent (Puy-de-Dôme).
2012
Guigue J, Mathieu O, Lévêque J, Kaisermann A, Sarr A, Milloux M-J, Ranjard L, Maron P-A.
Influence of microbial diversity on soil organic carbon dynamics highlighted by a 13C-labelling technique.
Joint European Stable Isotope Users Group Meeting JESIUM (2-7 Septembre). Leipzig, Allemagne.
Constancias F, Nowak V, Dequiedt S, Biju-Duval L, Guillemin J-P, Joffre R, Martins J, Prévost-Bouré NC, Ranjard L.
Spatial patterns of microbial communities at a soil micro-scale.
14th International Symposium on Microbial Ecology ISME (19 – 24 Août). Copenhague, Danemark.
Plassart P, Terrat S, Griffiths R, Thomson B, Dequiedt S, Lelièvre M, Régnier T, Bailey M, Philippot L, Bispo A, Maron P-A, Mougel C, Lemanceau P, Ranjard L.
Evaluation of the ISO standard 11063 "Soil DNA Extraction Procedure" for Assessing Microbial Abundance and Community Structure.
14th International Symposium on Microbial Ecology ISME (19 – 24 Août). Copenhague, Danemark.
Terrat S, Dequiedt S, Bachar D, Christen R, Mougel C, Lelièvre M, Maron P-A, Plassart P, Wincker P, Cruaud C, Jolivet C, Arrouays D, Bispo A, Lemanceau P, Ranjard L.
Deep sequencing of 16S rRNA gene to efficiently assess bacterial richness and the rare biosphere in soils.
14th International Symposium on Microbial Ecology ISME (19 – 24 Août). Copenhague, Danemark.
Constancias F, Nowak V, Dequiedt S, Guillemin J-P, Martins J, Prévost-Bouré NC, Ranjard L.
Spatial patterns of telluric microbial communities at a micro-scale according to soil management.
Fourth International congress of the European Confederation of Soil Science Societies (2 – 6 Juillet). Bari, Italie.
Prévost-Bouré NC, Dequiedt S, Nicolas S, Thioulouse J, Jolivet C, Lelièvre M, Arrouays D, Ranjard L.
Spatial process driving soils microbial community assembly on a wide.
Fourth International congress of the European Confederation of Soil Science Societies (2 – 6 Juillet). Bari, Italie.
Terrat S, Dequiedt S, Christen R, Bachar D, Lelièvre M, Régnier T, Nowak V, Plassart P, Wincker P, Lemanceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L.
Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité et la richesse des communautés microbiennes de sols issus d'échantillonnage de grande ampleur.
Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE (23 – 27 Avril). Aussois, France.
Terrat S, Plassart P, Christen R, Dequiedt S, Lelièvre M, Nowak V, Régnier T, Wincker P, Lemenceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L.
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols.
Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE (23 – 27 Avril). Aussois, France.
Bastian F, Mathieu O, Houdusse F, Fuentes M, Garcia-Mina Jose M, Lévêque J, Yvin J-C, Maron P-A, Lemenager D.
Evaluation of the addition of fertilizing component on microbial communities and decomposition of organic matter in soil.
European Geosciences Union General Assembly 2012 (22 – 27 Avril). Vienne, Autriche.
Bastian F, Mathieu O, Houdusse F, Fuentes M, Garcia Mina Jose M, Lévêque J, Yvin J-C, Maron P-A, Lemenager D.
Evaluation de l’effet d’un complément de fertilisation sur les communautés microbiennes et la décomposition des matières organiques dans le sol.
Journées d’études des sols : Le sol face aux changements globaux (19 – 23 Mars).Versailles, France.
Terrat S, Dequiedt S, Christen R, Lelièvre M, Régnier T, Nowak V, Plassart P, Wincker P, Lemanceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L.
Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes.
Journées d'animation "MEM Days" organisée par l'INRA (31 Janvier – 1 Février). Ecully, France.
2011
Terrat S, Christen R, Dequiedt R, Maron P-A, Mougel C, Perrière G, Ranjard L.
Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes.
1ère Rencontres bioinformaticiens et statisticiens de l’INRA (24 - 25 Mars). Versailles, France.
Prévost-Bouré NC, Dequiedt S, Saby NPA, Jolivet C, Lelièvre M, Arrouays D, Ranjard L.
Soil fungal communities ecology: a biogeographical approach.
Ecology of Soil Microorganisms. Microbes as Important Drivers of Soil Processes (27 Avril – 1 Mai). Prague, République Tchèque.
Dequiedt S, Saby NPA, Lelièvre M, Jolivet C, Thioulouse J, Toutain B, Arrouays D, Bispo A, Lemanceau P, Ranjard L.
Biogeographical patterns of soil molecular microbial biomass.
Ecology of Soil Microorganisms. Microbes as Important Drivers of Soil Processes (27 Avril – 1 Mai). Prague, République Tchèque.
Sarr A, Kaisermann A, Mathieu O, Lévêque J, Baumann K, Dignac M-F, Rumpel C, Chabbi A, Ranjard L, Fontaine S, Maron P-A.
Relationship between microbial diversity and soil organic matter turnover.
Ecology of Soil Microorganisms. Microbes as Important Drivers of Soil Processes (27 Avril – 1 Mai). Prague, République Tchèque.
Lienhard P, Joffre R, Maron P-A, Tivet F, Séguy L, Chabanne A, Legoupil JC, Sayphoummie S, Leudphanane B, Nowak V, Régnier T, Lelièvre M, Dequiedt D, Ranjard L.
Near infrared reflectance spectroscopy and molecular tools to evaluate land use impact on soil characteristics and microbiota: a case study in a tropical ecosystem (altitude plains, Lao PDR).
6th International Symposium of Interactions of Soil Minerals with Organic Components and Microorganisms ISMOM (26 Juin – 1 Juillet). Montpellier, France.
Terrat S, Christen R, Dequiedt S, Mougel C, Lelièvre M, Maron P-A, Plassart P, Wincker P, Cruaud C, Jolivet C, Arrouays D, Bispo A, Lemanceau P, Ranjard L.
Influence of Soil DNA Extraction Procedure to Assess Bacterial Diversity using Pyrosequencing of 16S rDNA.
6th International Symposium of Interactions of Soil Minerals with Organic Components and Microorganisms ISMOM (26 Juin – 1 Juillet). Montpellier, France.
Navel A, Martins JM-F, Ranjard L, Maron P-A, Manceau A, Lamy I, Faure P, Novak V, Vince E, Spadini L.
Relationships between copper impact on bacterial community and the microscale localisation of added copper, organic matter and microorganisms in vineyard soils.
11th International Conference on the Biogeochemistry of Trace Elements ICOBTE (3 – 7 Juillet). Florence, Italie.
Baumann K, Rumpel C, Dignac M-F, Chabbi A, Ranjard L, Mathieu O, Lévêque J, Maron P-A.
Soil microbial diversity effects organic matter decomposition.
International Symposium on Soil Organic Matter. Organic matter dynamics – from soils to oceans (11 – 14 Juillet). Leuven, Belgique.
Baumann K, Rumpel C, Dignac M-F, Chabbi A, Ranjard L, Mathieu O, Lévêque J, Maron P-A.
Soil microbial diversity effects organic matter decomposition.
Botaniker Tagung. “Diversity makes the difference” (18 – 23 Septembre). Berlin, Allemagne.
Dequiedt S, Prévost Bouré NC, Lelièvre M, Jolivet C, Arrouays D, Saby NPA, Thioulouse J, Lemanceau P, Ranjard L.
Processus d’assemblage des communautés microbiennes du sol à grande échelle.
5ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (14 – 16 Novembre). Hammamet, Tunisie.
Plassart P, Terrat S, Lelièvre M, Régnier T, Dequiedt S, Thomson B, Griffiths R, Bailey M, Mougel C, Lemanceau P, Ranjard L.
Vers une optimisation de la procédure d'extraction d'ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes ribosomiques.
5ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (14 – 16 Novembre). Hammamet, Tunisie.
Sarr A, Mathieu O, Lévêque J, Baumann K, Dignac M-F, Rumpel C, Chabbi A, Dequiedt S, Ranjard L, Fontaine S, Maron P-A.
Relation entre mode d’usage agronomique, diversité microbienne et turn-over des matières organiques dans le sol.
5ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (14 – 16 Novembre). Hammamet, Tunisie.
Terrat S, Plassart P, Christen R, Dequiedt S, Lemanceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L.
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols.
5ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (14 – 16 Novembre). Hammamet, Tunisie.
Ranjard L.
Le projet ECOMIC-RMQS ou comment faire de la MetaTaxogénomique à grande échelle.
Colloque de Génomique Environnementale des réseaux thématiques Génomique Environnementale (RTP GE, INEE) et Ecologie Microbienne (EcoMic, INRA) (28 – 30 Novembre). Lyon, France.
Terrat S, Plassart P, Christen R, Dequiedt S, Lelièvre M, Nowak V, Régnier T, Wincker P, Lemenceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L.
Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols.
Colloque de Génomique Environnementale des réseaux thématiques Génomique Environnementale (RTP GE, INEE) et Ecologie Microbienne (EcoMic, INRA) (28 – 30 Novembre). Lyon, France.
2010
Anane M, Bouziri L, Hydri Y, Lata JC, Marron P-A, Nazaret S, Ranjard L.
Spatial database to assess the impact of wastewater irrigation on Nabeul’s districts (Tunisia).
Tuniso-Indien cooperation Workshop on water technologies 22 – 26 Février), Tunis, Tunisie.
Bouziri L, Anane M, Hidri Y, Maron P-A, Lata JC, Ranjard L.
Impact assessment of irrigation by treated wastewater on the soil structure of bacterial genetic diversity from irrigated areas of Nabeul.
Vème congrès international QPE-TVR 2010 Qualité des Produits et de l’Environnement : Traitement et Valorisation des Rejets (9 – 11 Avril). Sousse, Tunisie.
Dequiedt S, Saby NPA, Thioulouse J, Prévost Bouré NC, Lelièvre M, Jolivet C, Maron P-A, Martin M, Arrouays D, Lemanceau P, Ranjard L.
Biogeographical patterns of soil microbial communities at the scale of French metropolitan territory.
13th International Symposium on Microbial Ecology ISME (22 – 27 Août). Seattle, USA.
Locatelli A, Ranjard L, Dequiedt S, Jolivet C, Depret G, Hartmann A.
Prevalence of several human pathogens in french soils.
13th International Symposium on Microbial Ecology ISME (22 – 27 Août). Seattle, USA.
Prévost Bouré NC, Dequiedt S, Saby NPA, Lelièvre M, Jolivet C, Arrouays D, Thioulouse J, Maron P-A, Lemanceau P, Ranjard L.
Microbial Biogeography : myth or reality ?
Colloque d'écologie scientifique (2 – 4 Septembre). Montpellier, France.
Mathieu O, Lévêque J, Kaisermann A, Guigue J, Naulier M, Sarr A, Milloux MJ, Ranjard L, Maron PA. 2010.
Soil organic matter turnover under microbial diversity: estimating the priming effect and dynamics of labile and stable organic carbon using 13C labelling technique.
6ème Congrès de la Société Française des Isotopes Stable SFIS (26 – 29 Octobre). Toulouse, France.
2009
Pascault N, Cécillon L, Lévêque J, Ranjard L, Maron P-A.
Devenir de résidus de culture de différentes qualités biochimiques après incorporation dans le sol : lien entre la diversité microbienne et l’évolution des résidus.
Congrès du réseau Dynamique et fonctions des matières organiques des sols et des eaux ResMO (25 – 28 Janvier). Sainte-Maxime, France.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Arrouays D, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Lemanceau P, Ranjard L.
Diversité des communautés microbiennes telluriques à l’échelle du territoire national.
10èmes Journées d'Étude des Sols organisées par l’AFES, la SSSB et la SSP (11 – 15 Mai). Strasbourg, France.
Prévost Bouré NC, Dequiedt S, Thioulouse J, Jolivet C, Saby NPA, Lelièvre M, Maron P-A, Martin M, Arrouays D, Lemanceau P, Ranjard L.
Microbial-biogeography at the scale of France by the use of molecular tools applied to the French soil quality monitoring network (RMQS).
Bacterial Genetics and Ecology – Coexisting on a Changing Planet BAGECO (15 – 19 Juin). Uppsala, Suède.
Dequiedt S, Lelièvre M, Maron PA, Mougel C, Prévost-Bouré NC, Morin F, Jolivet C, Arrouays D, Lemanceau P, Ranjard R.
Platform GenoSol : a New Tool for Conserving and Exploring Soil Microbial Diversity.
Bacterial Genetics and Ecology – Coexisting on a Changing Planet BAGECO (15 – 19 Juin). Uppsala, Suède.
Prévost-Bouré NC, Dequiedt S, Doyen R, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Toutain B, Arrouays D, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Maron PA, Lemanceau P, Ranjard L.
Distribution et déterminisme de la diversité des communautés de champignons telluriques à l’échelle de trois régions françaises.
4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Toutain B, Arrouays D, Prévost-Bouré NC, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Maron P-A, Lemanceau P, Ranjard L.
Platform GenoSol: a New Tool for Conserving and Exploring Soil Microbial Diversity.
4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Toutain B, Arrouays D, Prévost-Bouré NC, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Maron P-A, Lemanceau P, Ranjard R.
Patterns biogéographiques de la diversité bactérienne des sols à l’échelle du territoire national.
4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.
Henry S, Colinon C, Favre-Bonté S, Brothier E, Briolay J, Ranjard L, Cournoyer B, Hartmann A, Jolivet C, Nazaret S.
Distribution de bactéries pathogènes dans les sols évaluée par PCR quantitative en temps réel.
4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.
Pascault N, Henault C, Mathieu O, Lévêque J, Ranjard L, Maron P-A.
Dynamique et identification par DNA-SIP des communautés bactériennes impliquées dans la dégradation de résidus de blé, colza et luzerne et la minéralisation des matières organiques du sol.
4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.
R. Joffre, Gogé F, Jolivet C, Saby NPA, Dequiedt S, Lelièvre M, Ranjard L.
Exploring the links between Vis NIR spectra and bacterial communities structure of soils by PLS2 regression models.
14th International Congress NIRS (7 – 16 Novembre). Bangkok, Thaïlande.
2008
Maron P-A.
Apport de l’isotopie couplée aux outils de biologie moléculaire (DNA/RNA-SIP) pour caractériser la dynamique des communautés impliquées dans la dégradation de résidus de blé et la minéralisation des matières organiques du sol.
Ecole-chercheurs Utilisation des isotopes stables en écologie (13 – 16 Mai). Nancy, France.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Saby NPA, Martin M, Toutain B, Thioulouse J, Harmand J, Loisel P, Arrouays D, Lemanceau P, Ranjard L.
Microbial-biogeography of France by the use of molecular tools applied to the French soil quality monitoring network (RMQS).
Eurosoil congress (25 – 29 Août), Vienne, Autriche.
Pascault N, Cécillon L, Lévêque J, Ranjard L, Maron P-A.
Fate of crop residues incorporated in soil: towards linking microbial diversity and evolution of organic matter.
Eurosoil congress (25 – 29 Août), Vienne, Autriche.
Maron P-A, Mercier A, Ranjard L.
Metaproteomics: a new approach for studying functional microbial ecology
Eurosoil congress (25 – 29 Août), Vienne, Autriche.
2007
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Arrouays D, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Lemanceau P, Ranjard L.
Le projet ECOMIC-RMQS ou comment faire de la microbiogéographie à l’échelle de la France.
Journées d’animations scientifiques des ORE ACBB (Septembre). Lusignan, France.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Arrouays D, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Lemanceau P, Ranjard R.
Microbio-géographie à l’échelle du territoire national.
3ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (15 – 18 Octobre). La Grande Motte, France.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Arrouays D, Martin M, Saby NPA, Thioulouse J, Lemanceau P, Ranjard L.
Influence du type de sol et du mode d’occupation des sols sur la quantité d’ADN extraite et la densité des communautés bactériennes indigènes.
3ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (15 – 18 Octobre). La Grande Motte, France.
Ranjard L.
ECOMIC-RMQS
5ème journées de l’IFB (3 – 5 Décembre). Tours, France.