Exploring the microbial world To better protect our environment

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Conferences & Communication

2013

W Horrigue, L Ranjard, S Dequiedt. Predictive model of soil molecular microbial biomass by using the French soil quality monitoring network data. 2nd Thunen Symposium on soil Metagenomics, December 11-13 2013, Braunschweig, Germany.
S Terrat, S Dequiedt, M lelievre, R Christen, PA Maron, L Ranjard. Gns-Pipe an optimized bioinformatic pipeline to efficiently assess microbila taxonomic diversity of complex environement using high throughput sequencing technologies. 2nd Thunen Symposium on soil Metagenomics, December 11-13 2013, Braunschweig, Germany.
HORRIGUE Walid, DEQUIEDT Samuel, PAMARON Pierre Alain, Ranjard Lionel. Modèles prédictifs de l'abondance et de la diversité microbienne tellurique. Congres AFEM, 22-25 octobre 2013, Parent (Puy-de-Dôme).
Sébastien TERRAT, Pierre PLASSART, Emilie BOURGEOIS, Stéphanie FERREIRA, Mélanie LELIEVRE, Tiffanie REGNIER, Virginie NOWAK, Samuel DEQUIEDT, Philippe LEMANCEAU, Antonio BISPO, Abbad CHABBI, Pierre-Alain MARON, Lionel RANJARD. Optimisation de la procédure d’extraction d’ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par pyroséquençage des gènes ribosomiques. Congres AFEM, 22-25 octobre 2013, Parent (Puy-de-Dôme).

2012

Plassart P, Terrat S, Griffiths R, Thomson B, Dequiedt S, Lelièvre M, Régnier T, Bailey M, Philippot L, Bispo A, Maron P-A, Mougel C, Lemanceau P, Ranjard L. Evaluation of the ISO standard 11063 "Soil DNA Extraction Procedure" for Assessing Microbial Abundance and Community Structure. 14th International Symposium on Microbial Ecology ISME (19 – 24 Août). Copenhague, Danemark.
Terrat S, Dequiedt S, Bachar D, Christen R, Mougel C, Lelièvre M, Maron P-A, Plassart P, Wincker P, Cruaud C, Jolivet C, Arrouays D, Bispo A, Lemanceau P, Ranjard L. Deep sequencing of 16S rRNA gene to efficiently assess bacterial richness and the rare biosphere in soils. 14th International Symposium on Microbial Ecology ISME (19 – 24 Août). Copenhague, Danemark.
Constancias F, Nowak V, Dequiedt S, Guillemin J-P, Martins J, Prévost-Bouré NC, Ranjard L. Spatial patterns of telluric microbial communities at a micro-scale according to soil management. Fourth International congress of the European Confederation of Soil Science Societies (2 – 6 Juillet). Bari, Italie.
Terrat S, Plassart P, Christen R, Dequiedt S, Lelièvre M, Nowak V, Régnier T, Wincker P, Lemenceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L. Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols. Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale ETEGE (23 – 27 Avril). Aussois, France.
Bastian F, Mathieu O, Houdusse F, Fuentes M, Garcia-Mina Jose M, Lévêque J, Yvin J-C, Maron P-A, Lemenager D. Evaluation of the addition of fertilizing component on microbial communities and decomposition of organic matter in soil. European Geosciences Union General Assembly 2012 (22 – 27 Avril). Vienne, Autriche.
Bastian F, Mathieu O, Houdusse F, Fuentes M, Garcia Mina Jose M, Lévêque J, Yvin J-C, Maron P-A, Lemenager D. Evaluation de l’effet d’un complément de fertilisation sur les communautés microbiennes et la décomposition des matières organiques dans le sol. Journées d’études des sols : Le sol face aux changements globaux (19 – 23 Mars).Versailles, France.

2011

Prévost-Bouré NC, Dequiedt S, Saby NPA, Jolivet C, Lelièvre M, Arrouays D, Ranjard L. Soil fungal communities ecology: a biogeographical approach. Ecology of Soil Microorganisms. Microbes as Important Drivers of Soil Processes (27 Avril – 1 Mai). Prague, République Tchèque.
Dequiedt S, Saby NPA, Lelièvre M, Jolivet C, Thioulouse J, Toutain B, Arrouays D, Bispo A, Lemanceau P, Ranjard L. Biogeographical patterns of soil molecular microbial biomass. Ecology of Soil Microorganisms. Microbes as Important Drivers of Soil Processes (27 Avril – 1 Mai). Prague, République Tchèque.
Plassart P, Terrat S, Lelièvre M, Régnier T, Dequiedt S, Thomson B, Griffiths R, Bailey M, Mougel C, Lemanceau P, Ranjard L. Vers une optimisation de la procédure d'extraction d'ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes ribosomiques. 5ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (14 – 16 Novembre). Hammamet, Tunisie.
Sarr A, Mathieu O, Lévêque J, Baumann K, Dignac M-F, Rumpel C, Chabbi A, Dequiedt S, Ranjard L, Fontaine S, Maron P-A. Relation entre mode d’usage agronomique, diversité microbienne et turn-over des matières organiques dans le sol. 5ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (14 – 16 Novembre). Hammamet, Tunisie.
Terrat S, Plassart P, Christen R, Dequiedt S, Lemanceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L. Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols. 5ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (14 – 16 Novembre). Hammamet, Tunisie.
Terrat S, Plassart P, Christen R, Dequiedt S, Lelièvre M, Nowak V, Régnier T, Wincker P, Lemenceau P, Maron P-A, Mougel C, Ranjard L. Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols. Colloque de Génomique Environnementale des réseaux thématiques Génomique Environnementale (RTP GE, INEE) et Ecologie Microbienne (EcoMic, INRA) (28 – 30 Novembre). Lyon, France.

2010

Dequiedt S, Saby NPA, Thioulouse J, Prévost Bouré NC, Lelièvre M, Jolivet C, Maron P-A, Martin M, Arrouays D, Lemanceau P, Ranjard L. Biogeographical patterns of soil microbial communities at the scale of French metropolitan territory. 13th International Symposium on Microbial Ecology ISME (22 – 27 Août). Seattle, USA.
Locatelli A, Ranjard L, Dequiedt S, Jolivet C, Depret G, Hartmann A. Prevalence of several human pathogens in french soils. 13th International Symposium on Microbial Ecology ISME (22 – 27 Août). Seattle, USA.
Mathieu O, Lévêque J, Kaisermann A, Guigue J, Naulier M, Sarr A, Milloux MJ, Ranjard L, Maron PA. 2010. Soil organic matter turnover under microbial diversity: estimating the priming effect and dynamics of labile and stable organic carbon using 13C labelling technique. 6ème Congrès de la Société Française des Isotopes Stable SFIS (26 – 29 Octobre). Toulouse, France.

2009

Prévost Bouré NC, Dequiedt S, Thioulouse J, Jolivet C, Saby NPA, Lelièvre M, Maron P-A, Martin M, Arrouays D, Lemanceau P, Ranjard L. Microbial-biogeography at the scale of France by the use of molecular tools applied to the French soil quality monitoring network (RMQS). Bacterial Genetics and Ecology – Coexisting on a Changing Planet BAGECO (15 – 19 Juin). Uppsala, Suède.
Dequiedt S, Lelièvre M, Maron PA, Mougel C, Prévost-Bouré NC, Morin F, Jolivet C, Arrouays D, Lemanceau P, Ranjard R. Platform GenoSol : a New Tool for Conserving and Exploring Soil Microbial Diversity. Bacterial Genetics and Ecology – Coexisting on a Changing Planet BAGECO (15 – 19 Juin). Uppsala, Suède.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Toutain B, Arrouays D, Prévost-Bouré NC, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Maron P-A, Lemanceau P, Ranjard L. Platform GenoSol: a New Tool for Conserving and Exploring Soil Microbial Diversity. 4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.
Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Martin M, Saby NPA, Toutain B, Arrouays D, Prévost-Bouré NC, Harmand J, Loisel P, Thioulouse J, Maron P-A, Lemanceau P, Ranjard R. Patterns biogéographiques de la diversité bactérienne des sols à l’échelle du territoire national. 4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.
Henry S, Colinon C, Favre-Bonté S, Brothier E, Briolay J, Ranjard L, Cournoyer B, Hartmann A, Jolivet C, Nazaret S. Distribution de bactéries pathogènes dans les sols évaluée par PCR quantitative en temps réel. 4ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (29 Août – 2 Septembre). Lyon, France.

2007

Dequiedt S, Lelièvre M, Jolivet C, Arrouays D, Martin M, Saby NPA, Thioulouse J, Lemanceau P, Ranjard L. Influence du type de sol et du mode d’occupation des sols sur la quantité d’ADN extraite et la densité des communautés bactériennes indigènes. 3ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne AFEM (15 – 18 Octobre). La Grande Motte, France.